RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PDGFAP04085 211 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PGAM1P18669 254 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MMP11P24347 488 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PSMB5P28074 263 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PNLIPRP1P54315 467 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ABATP80404 500 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 RBBP7Q16576 425 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 KCNMB4Q86W47 210 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CABS1Q96KC9 395 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NUDT9Q9BW91 350 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 DHRS7Q9Y394 339 aa16.19■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 AGPSO00116 658 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CTSBP07858 339 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MCM3P25205 808 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLC1A2P43004 574 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CLCN7P51798 805 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 RAPSNQ13702 412 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MYBPC3Q14896 1274 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ADCK2Q7Z695 626 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MCOLN3Q8TDD5 553 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SEMA3GQ9NS98 782 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa16.18■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 OR2A25A4D2G3 310 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SMAPO00193 183 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CTSVO60911 334 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ONECUT2O95948 504 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ANXA5P08758 320 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 HRH2P25021 359 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ITGA3P26006 1051 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MAGEA3P43357 314 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CD97P48960 835 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 EMP3P54852 163 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NKG7Q16617 165 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NADK2Q4G0N4 442 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ICE2Q659A1 982 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 RNF44Q7L0R7 432 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PDIK1LQ8N165 341 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ASB11Q8WXH4 323 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MIEF2Q96C03 454 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PKP4Q99569 1192 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 GPR21Q99679 349 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 MFRPQ9BY79 579 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 TAC3Q9UHF0 121 aa16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PPV9 198 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 ERGP11308 486 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 PAFAH1B1P43034 410 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 OR1D4P47884 311 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 CUL1Q13616 776 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 NDUFA9Q16795 377 aa16.16■□□□□ 0.18
CASP9-211ENST00000546969 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms