RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 GRID2O43424 1007 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 B4GALT2O60909 372 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ALPPP05187 535 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 AHCYP23526 432 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 IL4RP24394 825 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 KIR3DL1P43629 444 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PHC1P78364 1004 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 BNIP3Q12983 259 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 TRNP1Q6NT89 227 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SCD5Q86SK9 330 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ART5Q96L15 291 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 WDR92Q96MX6 357 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 GPER1Q99527 375 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SIAEQ9HAT2 523 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 IKZF2Q9UKS7 526 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HYKKA2RU49 373 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HCN1O60741 890 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 TSPAN19P0C672 248 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PRKCHP24723 683 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 GRIA4P48058 902 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HCAR3P49019 387 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 MPP2Q14168 576 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 26.9
CLIP1-218ENST00000545889 EML3Q32P44 896 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SMPDL3AQ92484 453 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 IPPKQ9H8X2 491 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SNX7Q9UNH6 387 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 A0A1W2PQU0 124 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 OR5K4A6NMS3 321 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 C8GP07360 202 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 VIPR1P32241 457 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HSPA13P48723 471 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PNLIPRP1P54315 467 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 EPS8Q12929 822 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 RAB33AQ14088 237 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ABHD13Q7L211 337 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF567Q8N184 647 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 HTRA1Q92743 480 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 NTAN1Q96AB6 310 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CRELD1Q96HD1 420 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CASKO14936 926 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CXCL10P02778 98 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ITGA3P26006 1051 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ACVRL1P37023 503 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 KCNJ8Q15842 424 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CEP78Q5JTW2 689 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 PQLC3Q8N755 202 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 ITCHQ96J02 903 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 DGAT2Q96PD7 388 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 SPTBN2O15020 2390 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 FAM20BO75063 409 aa8.39□□□□□ -1.07
CLIP1-218ENST00000545889 LINC00032P0C843 101 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms