RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 ZNF480Q8WV37 535 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 ATL1Q8WXF7 558 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 ARL15Q9NXU5 204 aa16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
PACS1-208ENST00000529677 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
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PACS1-208ENST00000529677 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.27■□□□□ 0.2
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PACS1-208ENST00000529677 KRT87PA6NCN2 255 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 ZNF839A8K0R7 811 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.26■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 STX16O14662 325 aa16.26■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 TAC1P20366 129 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 GPR3P46089 330 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SLC6A12P48065 614 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 TLE1Q04724 770 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SETDB1Q15047 1291 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 SULT1C3Q6IMI6 304 aa16.26■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 NAT6Q93015 286 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 OR6C2Q9NZP2 312 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 CD274Q9NZQ7 290 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 COPG2Q9UBF2 871 aa16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 A8MT66 165 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 E7ENX8 843 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 TAPBPO15533 448 aa16.25■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 SMIM24O75264 130 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 IPO13O94829 963 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 FAM87AP0C7U9 286 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
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PACS1-208ENST00000529677 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 RAB42Q8N4Z0 105 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 OR56A3Q8NH54 315 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 LCN9Q8WX39 176 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 CCDC126Q96EE4 140 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 IL17FQ96PD4 163 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 GUCA1CO95843 209 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 S100BP04271 92 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 MYL2P10916 166 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 CPA3P15088 417 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 NR1D1P20393 614 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PRKAA2P54646 552 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 DNAJB13P59910 316 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 DAB2P98082 770 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SQSTM1Q13501 440 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 46.1
PACS1-208ENST00000529677 GUSBP11Q6P575 273 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SLC22A9Q8IVM8 553 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 EXT2Q93063 718 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 EGFL8Q99944 293 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 SGPP1Q9BX95 441 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 OXSMQ9NWU1 459 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-208ENST00000529677 OGFRQ9NZT2 677 aa16.24■□□□□ 0.19
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