RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 RPS6KA2Q15349 733 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 KIF19Q2TAC6 998 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 UAP1L1Q3KQV9 507 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SPATS1Q496A3 300 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 XKR6Q5GH73 641 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ATG9BQ674R7 924 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 LCTLQ6UWM7 567 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 FAM129CQ86XR2 697 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 LAS2Q8IYD9 372 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 DPP10Q8N608 796 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 OR7G3Q8NG95 312 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 HMGB4Q8WW32 186 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NEIL2Q969S2 332 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CLDN23Q96B33 292 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SPDL1Q96EA4 605 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR92Q96MX6 357 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM74Q96NL1 305 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 IL17FQ96PD4 163 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 OR2M4Q96R27 311 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CDRT15Q96T59 188 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 HBEGFQ99075 208 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NELL2Q99435 816 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PRRX2Q99811 253 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 HAUS8Q9BT25 410 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NT5DC2Q9H857 520 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 BRF2Q9HAW0 419 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CD320Q9NPF0 282 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CROTQ9UKG9 612 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SUFUQ9UMX1 484 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 DMTF1Q9Y222 760 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 POMPQ9Y244 141 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ASF1AQ9Y294 204 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CFAP54Q96N23 3096 aa6.87□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 A6NCN8 305 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF839A8K0R7 811 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NR5A2O00482 541 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ACOT8O14734 319 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SEC22BO75396 215 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CIB2O75838 187 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NPPAP01160 153 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PRPS2P11908 318 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ACP5P13686 325 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 AMD1P17707 334 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 IDSP22304 550 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PKLRP30613 574 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 THOP1P52888 689 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 NME5P56597 212 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 FOXM1Q08050 763 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PRKG2Q13237 762 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 ART3Q13508 389 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 LAPTM5Q13571 262 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CCNIQ14094 377 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CLCA4Q14CN2 919 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SNCBQ16143 134 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 RPE65Q16518 533 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 SGO1Q5FBB7 561 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.86□□□□□ -1.31
UBASH3B-203ENST00000526386 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms