RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521948.1

UQCRB-208, Transcript of ubiquinol-cytochrome c reductase binding protein, human

TSL 2

Gene UQCRB, Length 997 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UQCRB-208	ENST00000521948	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	USP6	P35125	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	WDPCP	O95876	746 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CSRP3	P50461	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	GRAP	Q13588	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	AMER3	Q8N944	861 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ACE	P12821	1306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CTDSP2	O14595	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PI15	O43692	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ACADS	P16219	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	UGT1A4	P22310	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SHC1	P29353	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	HNF4A	P41235	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	HUNK	P57058	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	RALBP1	Q15311	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	MSH6	P52701	1360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	DCC	P43146	1447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	OR10H2	O60403	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TSPAN1	O60635	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	GJA1	P17302	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	MMP12	P39900	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PAX9	P55771	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	OMA1	Q96E52	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NSD2	O96028	1365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	NFAT5	O94916	1531 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UQCRB-208	ENST00000521948	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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