RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	WHRN	Q9P202	907 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846		H7C0S8	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FFAR3	O14843	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR42	O15529	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	EFS	O43281	561 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SUPT3H	O75486	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	NEFH	P12036	1026 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	EDN3	P14138	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SHMT2	P34897	504 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR3	P46089	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	TAS2R39	P59534	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CYP4F2	P78329	520 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	KCNJ13	O60928	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	B3GALT4	O96024	378 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GFAP	P14136	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	KRT15	P19012	456 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	NME2	P22392	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PAX7	P23759	505 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	IVD	P26440	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CAPZB	P47756	277 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FASLG	P48023	281 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CAV1	Q03135	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	RHBG	Q9H310	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SGTA	O43765	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	COQ9	O75208	318 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	OR2B3	O76000	313 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	STMN1	P16949	149 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CD9	P21926	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	AOAH	P28039	575 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	STX2	P32856	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	LSS	P48449	732 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	CDKN2D	P55273	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLVS1-205	ENST00000519846	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64

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