RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2A25	A4D2G3	310 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	TARM1	B6A8C7	271 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	MYO1C	O00159	1063 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	FFAR3	O14843	346 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	GPR42	O15529	346 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	KDM1A	O60341	852 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	SEMA7A	O75326	666 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	EFNA3	P52797	238 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	RRAD	P55042	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	MPP1	Q00013	466 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517		Q0VFX4	171 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC35F6	Q8N357	371 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	MCU	Q8NE86	351 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	TCF12	Q99081	682 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	DPH7	Q9BTV6	452 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RRM2B-204	ENST00000517517	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	BLACE	A4D250	179 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517		H0YGG7	62 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	AGPS	O00116	658 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	AP3B1	O00203	1094 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	KPNA5	O15131	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	DPM1	O60762	260 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	HAUS5	O94927	633 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MLN	P12872	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MMP11	P24347	488 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP5D	P30049	168 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CCNF	P41002	786 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC1A2	P43004	574 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PGGT1B	P53609	377 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ARSF	P54793	590 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SOX8	P57073	446 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GRM7	Q14831	915 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MYBPC3	Q14896	1274 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PAQR7	Q86WK9	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF480	Q8WV37	535 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	DLG3	Q92796	817 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	FKBP10	Q96AY3	582 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PBK	Q96KB5	322 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517		E7ENX8	843 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PEX12	O00623	359 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	P2RX6	O15547	441 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	USP1	O94782	785 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC16A8	O95907	504 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ALB	P02768	609 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	STATH	P02808	62 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	GABRB3	P28472	473 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	PNLIPRP1	P54315	467 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TAP2	Q03519	686 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	HKDC1	Q2TB90	917 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	VWA2	Q5GFL6	755 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TCTE1	Q5JU00	501 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF425	Q6IV72	752 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RRM2B-204	ENST00000517517	TTC23L	Q6PF05	361 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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