RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514621.5

HIPK1-210, Transcript of homeodomain interacting protein kinase 1, human

TSL 4

Gene HIPK1, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HIPK1-210	ENST00000514621	TMEM202	A6NGA9	273 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	C2orf81	A6NN90	581 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CCL22	O00626	93 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	MAP2K7	O14733	419 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	LDB2	O43679	373 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	DFNA5	O60443	496 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PRAMEF4	O60810	478 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SOD1	P00441	154 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ABHD2	P08910	425 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	NUDT17	P0C025	328 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CD59	P13987	128 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	TSHR	P16473	764 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	NMBR	P28336	390 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	TEAD1	P28347	426 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	STX2	P32856	288 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PHB	P35232	272 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GPR1	P46091	355 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	RXRG	P48443	463 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	THOP1	P52888	689 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	KIAA1024L	P59773	190 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	DCDC1	P59894	354 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	TMPRSS15	P98073	1019 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CDK3	Q00526	305 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	IL9R	Q01113	521 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	KLF10	Q13118	480 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PTK2B	Q14289	1009 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PTPRCAP	Q14761	206 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	NFATC4	Q14934	902 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ALS2CL	Q60I27	953 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	MACC1	Q6ZN28	852 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GPR26	Q8NDV2	337 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	LRRC39	Q96DD0	335 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ZNF778	Q96MU6	729 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	IL22	Q9GZX6	179 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	WDR26	Q9H7D7	661 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	IL26	Q9NPH9	171 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	IL17C	Q9P0M4	197 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PI4KA	P42356	2102 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CEP250	Q9BV73	2442 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	BPTF	Q12830	3046 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621		H3BQF6	201 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	AGPS	O00116	658 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	AP3B1	O00203	1094 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SLC30A4	O14863	429 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	INPP4B	O15327	924 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PCDHGA12	O60330	932 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	UGT1A9	O60656	530 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CSF2	P04141	144 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PYGL	P06737	847 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	IVL	P07476	585 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ZNF883	P0CG24	379 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	HTR1B	P28222	390 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ABCG1	P45844	678 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	NPY2R	P49146	381 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CCT8	P50990	548 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	PDE1B	Q01064	536 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SLC14A1	Q13336	389 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	TMED2	Q15363	201 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	CHRNA6	Q15825	494 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ALG11	Q2TAA5	492 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HIPK1-210	ENST00000514621	STEAP4	Q687X5	459 aa		6.43	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms