RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513524.5

GPBP1-206, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, human

TSL 5

Gene GPBP1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPBP1-206	ENST00000513524	RCN2	Q14257	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	KRT81	Q14533	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	RIT1	Q92963	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	ALG14	Q96F25	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GPBP1-206	ENST00000513524	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SNX3	O60493	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SELENOF	O60613	162 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PIGN	O95427	931 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	C9	P02748	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SP1	P08047	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FGF5	P12034	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LBP	P18428	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ST8SIA6	P61647	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	KLC1	Q07866	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PTGIS	Q16647	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PHKG1	Q16816	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PGM2	Q96G03	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524		A0A1W2PN81	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ARPC2	O15144	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CAVIN2	O95810	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NR3C1	P04150	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ITIH1	P19827	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PSMB4	P28070	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CHRNA7	P36544	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	HNF4A	P41235	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	STX1B	P61266	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ASIC1	P78348	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	UBXN1	Q04323	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TAF13	Q15543	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	NR4A3	Q92570	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	AK8	Q96MA6	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524		Q9H8V8	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	FLRT2	O43155	660 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CRCP	O75575	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CDH3	P22223	829 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GPBP1-206	ENST00000513524	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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