RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512382.1

FAM20C-204, Transcript of FAM20C, golgi associated secretory pathway kinase, human

TSL 2

Gene FAM20C, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM20C-204	ENST00000512382	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.94	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382		A0A0J9YVX5	310 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382		E7ENX8	843 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	NDC80	O14777	642 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	RAD51C	O43502	376 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	NRP2	O60462	931 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	RGS4	P49798	205 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PMS2	P54278	862 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	TAP2	Q03519	686 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	GRM7	Q14831	915 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DLG3	Q92796	817 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.93	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382		E7ESA3	106 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	SUV39H1	O43463	412 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	GCGR	P47871	477 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ARSF	P54793	590 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MGAT5	Q09328	741 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	WHRN	Q9P202	907 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ARGFX	A6NJG6	315 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	RFPL1	O75677	317 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DNAJB5	O75953	348 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	C8G	P07360	202 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	IMPA1	P29218	277 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PGGT1B	P53609	377 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	IL2	P60568	153 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	CBLB	Q13191	982 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	ICE2	Q659A1	982 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.91	□□□□□ -0.18
FAM20C-204	ENST00000512382	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.91	□□□□□ -0.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms