RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MROQ9BYG7 248 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SOCS5O75159 536 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK5O95279 499 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 EPHA2P29317 976 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ALDH4A1P30038 563 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HPCAL1P37235 193 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PTCHD3Q3KNS1 767 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 NEK5Q6P3R8 708 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC81Q6ZN84 652 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00299Q6ZSB3 139 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 VTCN1Q7Z7D3 282 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF540Q8NDQ6 660 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 YIPF6Q96EC8 236 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PANX1Q96RD7 426 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 APOL4Q9BPW4 351 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVW-1Q9UQF0 538 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ENGP17813 658 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 VLDLRP98155 873 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 B4GALNT1Q00973 533 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SREBF2Q12772 1141 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCA4Q14CN2 919 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PERM1Q5SV97 790 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA1841Q6NSI8 718 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 P2RY8Q86VZ1 359 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 S100ZQ8WXG8 99 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 COPS8Q99627 209 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC12A9Q9BXP2 914 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 BACE2Q9Y5Z0 518 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 GREM1O60565 184 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 NADKO95544 446 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FABP3P05413 133 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 AMD1P17707 334 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2ADP20671 130 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 VMACQ2NL98 169 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 NOXRED1Q6NXP6 359 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST1H2AJQ99878 128 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MYOCQ99972 504 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 H2AFJQ9BTM1 129 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF186Q9NXI6 227 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVK-11Q9UQG0 969 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A14Q9Y267 594 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAM23O75077 832 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 JRKO75564 520 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMB9P28065 219 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KDELR2P33947 212 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPK8P45983 427 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MASP1P48740 699 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 DGUOKQ16854 277 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX29P2Q8IUI4 249 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 CRIPAKQ8N1N5 446 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 L3MBTL4Q8NA19 623 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KRBA1A5PL33 1030 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 GFRA2O00451 464 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FPGTO14772 594 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF4O60810 478 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FPR1P21462 350 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 AOAHP28039 575 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXA9P31269 272 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPC1P48995 793 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 DUOXA1Q1HG43 343 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PAGE2BQ5JRK9 111 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FRG2Q64ET8 278 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF621Q6ZSS3 439 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM150AQ86TG1 271 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PGBD3Q8N328 593 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ASIC4Q96FT7 647 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 FRG2BQ96QU4 278 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM247A6NEH6 219 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-221ENST00000511747 UPK3BL1B0FP48 263 aa26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms