RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510921.5

CCNH-208, Transcript of cyclin H, human

TSL 4

Gene CCNH, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-208	ENST00000510921	DYRK2	Q92630	601 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	PROX1	Q92786	737 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	LRR1	Q96L50	414 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF599	Q96NL3	588 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CPVL	Q9H3G5	476 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	FN3K	Q9H479	309 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CHST11	Q9NPF2	352 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921		A0A087WV48	116 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	RPS6KA5	O75582	802 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	AP2A2	O94973	939 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	HSPA4L	O95757	839 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	GPI	P06744	558 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	HMBS	P08397	361 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CD48	P09326	243 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	MYL6B	P14649	208 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	PSMA3	P25788	255 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CDC25C	P30307	473 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	NOV	P48745	357 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	VAMP7	P51809	220 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CLDN15	P56746	228 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	UBASH3A	P57075	661 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TFCP2	Q12800	502 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	HERC3	Q15034	1050 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF790	Q6PG37	636 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921		Q8NFD4	153 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	OR4C3	Q8NH37	302 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SPATA33	Q96N06	139 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	GBP5	Q96PP8	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ASCL2	Q99929	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	MGME1	Q9BQP7	344 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	POLL	Q9UGP5	575 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TNN	Q9UQP3	1299 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921		A0A087WW49	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	NR5A2	O00482	541 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	PSMD14	O00487	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SNX3	O60493	162 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ATP6AP2	O75787	350 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	GSR	P00390	522 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	CEACAM1	P13688	526 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	HSD17B3	P37058	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	GP5	P40197	560 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ITGA9	Q13797	1035 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SQLE	Q14534	574 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TEAD2	Q15562	447 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	UGCG	Q16739	394 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	XKR6	Q5GH73	641 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	OR4A47	Q6IF82	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	G2E3	Q7L622	706 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	METTL23	Q86XA0	190 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	VSIG1	Q86XK7	387 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CCNH-208	ENST00000510921	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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