RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 VPS33BQ9H267 617 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MMRN2Q9H8L6 949 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SUN2Q9UH99 717 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DNPEPQ9ULA0 475 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MAB21L2Q9Y586 359 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 UTRNP46939 3433 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa2.16□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 C4AP0C0L4 1744 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 C4BP0C0L5 1744 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TAF1P21675 1872 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC3CA6NJW4 275 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MDM4O15151 490 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TO15178 435 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ATP9AO75110 1047 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TSC22D2O75157 780 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 E2F6O75461 281 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RGS11O94810 467 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SNX4O95219 450 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN7O95471 211 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINF2P08697 491 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DGKAP23743 735 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HRH2P25021 359 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HNMTP50135 292 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MMP15P51511 669 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC34A1Q06495 639 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 COX10Q12887 443 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MAPK11Q15759 364 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FILIP1LQ4L180 1135 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RAB6CQ53S08 254 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DCAF12L2Q5VW00 463 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 AGAP6Q5VW22 663 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC44A3Q8N4M1 653 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SLC44A5Q8NCS7 719 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 TRIB2Q92519 343 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MAP4K1Q92918 833 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RITA1Q96K30 269 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MRIQ9BWK5 157 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 ANKMY1Q9P2S6 941 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 SPASTQ9UBP0 616 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 RCOR1Q9UKL0 485 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa2.15□□□□□ -2.06
PDE4D-218ENST00000509368 PFASO15067 1338 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 IL16Q14005 1332 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PPW3 197 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 FEZF1A0PJY2 475 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MATN3O15232 486 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 NARSO43776 548 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 NEMFO60524 1076 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 HSF2BPO75031 334 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF202O95125 648 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GCP02774 474 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SERPING1P05155 500 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 FERP16591 822 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF23P17027 643 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ARFIP1P53367 373 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ADARP55265 1226 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CLDN15P56746 228 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PDE7AQ13946 482 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 DUSP6Q16828 381 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MIDNQ504T8 468 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa2.15□□□□□ -2.07
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PDE4D-218ENST00000509368 DSELQ8IZU8 1212 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 BEST3Q8N1M1 668 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SLC16A11Q8NCK7 471 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 FAM71CQ8NEG0 241 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC107Q8WV48 283 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 MTERF3Q96E29 417 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 SPATA33Q96N06 139 aa2.15□□□□□ -2.07
PDE4D-218ENST00000509368 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
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