RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PTGES3L	E9PB15	166 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	OR2T7	P0C7T2	308 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	HADHA	P40939	763 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	NR1D2	Q14995	579 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	C3AR1	Q16581	482 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SYT14P1	Q58G82	188 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	WDR78	Q5VTH9	848 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CEP57	Q86XR8	500 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CCDC107	Q8WV48	283 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PIGB	Q92521	554 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	C2orf48	Q96LS8	159 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ZNF597	Q96LX8	424 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	LINC00167	Q96N53	147 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	MIS12	Q9H081	205 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TRIM17	Q9Y577	477 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		2.68	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	DOK2	O60496	412 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PTP4A3	O75365	173 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	HYI	Q5T013	277 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	NUDT13	Q86X67	352 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	GPD1L	Q8N335	351 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	LGMN	Q99538	433 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SYNC	Q9H7C4	482 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	VSIG4	Q9Y279	399 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		2.67	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268		A6NCN8	305 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	VILL	O15195	856 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	PRAMEF11	O60813	436 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CEACAM4	O75871	244 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	HP	P00738	406 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	MFAP4	P55083	255 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SIRPA	P78324	504 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	MC1R	Q01726	317 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ITGA7	Q13683	1181 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TAB1	Q15750	504 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SPECC1	Q5M775	1068 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	REG3G	Q6UW15	175 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CDRT15	Q96T59	188 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	VPS28	Q9UK41	221 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	POMT2	Q9UKY4	750 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		2.66	□□□□□ -1.98
USP34-222	ENST00000498268	TEX28	O15482	410 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TOMM70	O94826	608 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CASP2	P42575	452 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	IRX4	P78413	519 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	FHL5	Q5TD97	284 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NOTUM	Q6P988	496 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		2.65	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		2.65	□□□□□ -1.99

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