RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 GCGRP47871 477 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CD151P48509 253 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 VPS41P49754 854 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MPP3Q13368 585 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 LRRC38Q5VT99 294 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 FCRL6Q6DN72 434 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 COX15Q7KZN9 410 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 OR13C4Q8NGS5 318 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 RELTQ969Z4 430 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NACC2Q96BF6 587 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CCDC120Q96HB5 630 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 COPS8Q99627 209 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NDC1Q9BTX1 674 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 FICDQ9BVA6 458 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 LHPPQ9H008 270 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.3□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 A0A1B0GX78 115 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 C2orf81A6NN90 581 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 E7EVH7 732 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CCL22O00626 93 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 RASGRF2O14827 1237 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 PCDH17O14917 1159 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 AGTP01019 485 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ITGALP20701 1170 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 HTR1EP28566 365 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 SHMT2P34897 504 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CDKN2BP42772 138 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CCT5P48643 541 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ITGA8P53708 1063 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 Q0VFX4 171 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 RPA4Q13156 261 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MFAP5Q13361 173 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 OLIG2Q13516 323 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NKG7Q16617 165 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 PID1Q7Z2X4 250 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NR4A3Q92570 626 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 DLG3Q92796 817 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ULK4Q96C45 1275 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 APOL2Q9BQE5 337 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 FAM96AQ9H5X1 160 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 WDR54Q9H977 334 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CTSFQ9UBX1 484 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.29□□□□□ -0.921e-18■■□□□ 11.4
NOP56-215ENST00000490753 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 HCFC1P51610 2035 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 C5orf60A6NFR6 353 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CST8O60676 142 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 KLHL18O94889 574 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 TPBGLP0DKB5 382 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 COX6B1P14854 86 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 MAGP20916 626 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 ALAS2P22557 587 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 LSP1P33241 339 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 NR2C2P49116 596 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 GEMP55040 296 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 GUCY1A3Q02108 690 aa9.28□□□□□ -0.92
NOP56-215ENST00000490753 SLC29A2Q14542 456 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms