RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	OR2T12	Q8NG77	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MYADM	Q96S97	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF580	Q9UK33	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TAF1	P21675	1872 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160		A0A087WV48	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PLOD2	O00469	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DDHD2	O94830	711 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	HEXB	P07686	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ITIH1	P19827	911 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NR1D1	P20393	614 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MPZ	P25189	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PDX1	P52945	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NAGLU	P54802	743 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DLX5	P56178	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	UBASH3A	P57075	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FEV	Q99581	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CPNE1	Q99829	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160		Q9N2K0	584 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	FGF17	O60258	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NR3C1	P04150	777 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PAX1	P15863	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ADRA2C	P18825	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	EPHA2	P29317	976 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KCNJ1	P48048	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	LHX1	P48742	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	KHK	P50053	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	TKTL1	P51854	596 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MAPK12	P53778	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GMFB	P60983	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	PDK1	Q15118	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ANO5	Q75V66	913 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCL20-204	ENST00000489160	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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