RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 VAPBO95292 243 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC25BP30305 580 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 FMO4P31512 558 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 RPS6KA1Q15418 735 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNG2Q16589 344 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 PRSS58Q8IYP2 241 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 C10orf90Q96M02 699 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 C5orf34Q96MH7 638 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 LHPPQ9H008 270 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.16■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 E2F3O00716 465 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNFP41002 786 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 NPY2RP49146 381 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 KLC1Q07866 573 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 GBX1Q14549 363 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf44Q96CB5 159 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 CNDP1Q96KN2 507 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 FOPNLQ96NB1 174 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 KIFC1Q9BW19 673 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 BFARQ9NZS9 450 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 MRFAP1Q9Y605 127 aa16.15■□□□□ 0.18
SKIV2L-211ENST00000485349 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 OR2A25A4D2G3 310 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MATN4O95460 622 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ERVK-10P10266 1014 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ERGP11308 486 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 DCTP40126 519 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNJ1P48048 391 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 TERF1P54274 439 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNMB4Q86W47 210 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 GRHL3Q8TE85 626 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MIEF2Q96C03 454 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 DPH7Q9BTV6 452 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 GALPQ9UBC7 116 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CREBBPQ92793 2442 aa16.14■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP2K7O14733 419 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 FFAR3O14843 346 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR42O15529 346 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 HPP00738 406 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 FGGP02679 453 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ACPPP15309 386 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP5DP30049 168 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CMPK1P30085 196 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 OCA2Q04671 838 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC16Q13042 620 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 VWA2Q5GFL6 755 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 C4orf22Q6V702 233 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CABS1Q96KC9 395 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 C3orf18Q9UK00 162 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 SOX13Q9UN79 622 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA12Q86UK0 2595 aa16.13■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.12■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 H0YGG7 62 aa16.12■□□□□ 0.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO1CO00159 1063 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms