RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 RELL1Q8IUW5 271 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 STARD8Q92502 1023 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 CHST8Q9H2A9 424 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.1■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 MGAQ8IWI9 3026 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1GO43497 2377 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.09■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.09■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2ADP20671 130 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ABATP80404 500 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.812e-36■■■■■ 41.3
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ACTB-211ENST00000480301 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ZNF425Q6IV72 752 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 SBSNQ6UWP8 590 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 RNF44Q7L0R7 432 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 PAQR7Q86WK9 346 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD7Q92527 254 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.08■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 GPR87Q9BY21 358 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 PCM1Q15154 2024 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa20.07■□□□□ 0.8
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ACTB-211ENST00000480301 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ITGB2P05107 769 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 AP1S2P56377 157 aa20.07■□□□□ 0.8
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ACTB-211ENST00000480301 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TBR1Q16650 682 aa20.07■□□□□ 0.8
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ACTB-211ENST00000480301 LINC00303Q3SY05 128 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.07■□□□□ 0.8
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ACTB-211ENST00000480301 OR4N4Q8N0Y3 316 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 EXTL1Q92935 676 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 WBP1Q96G27 269 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 GBP5Q96PP8 586 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 TSPYL1Q9H0U9 437 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 STARD5Q9NSY2 213 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ARL15Q9NXU5 204 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FITM1A5D6W6 292 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CREG1O75629 220 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.06■□□□□ 0.8
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