RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479894.1

HDLBP-238, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 840 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-238	ENST00000479894	ACRV1	P26436	265 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	NSG1	P42857	185 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PTPRCAP	Q14761	206 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TRADD	Q15628	312 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	C14orf79	Q96F83	325 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF778	Q96MU6	729 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	DNHD1	Q96M86	4753 aa		15	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A9	O60656	530 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A6	P19224	532 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CYP2A7	P20853	494 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A1	P22309	533 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A4	P22310	534 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	FOXN2	P32314	431 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	MGAT5	Q09328	741 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CDC16	Q13042	620 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	NAB1	Q13506	487 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PACS1	Q6VY07	963 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	BCORP1	Q8N888	145 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CERS2	Q96G23	380 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CCDC120	Q96HB5	630 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	OLAH	Q9NV23	265 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZFAT	Q9P243	1243 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		14.99	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	OR56A5	P0C7T3	313 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	FOLR3	P41439	243 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	DMPK	Q09013	629 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TLR1	Q15399	786 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	EMB	Q6PCB8	327 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	XKRX	Q6PP77	449 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CES3	Q6UWW8	571 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	GALNT7	Q86SF2	657 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	OR1L3	Q8NH93	324 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	NACC2	Q96BF6	587 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PWWP2A	Q96N64	755 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CCDC77	Q9BR77	488 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CCL22	O00626	93 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PCDH17	O14917	1159 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	KPNA5	O15131	536 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ERLIN1	O75477	346 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	FAM155B	O75949	473 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	FTH1	P02794	183 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ESR1	P03372	595 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	RPE65	Q16518	533 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		14.97	□□□□□ -0.01
HDLBP-238	ENST00000479894	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		14.97	□□□□□ -0.01

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