RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334		Q6ZSR9	355 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	DYRK2	Q92630	601 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA33	Q96N06	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	FN3K	Q9H479	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CHST11	Q9NPF2	352 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CHKB	Q9Y259	395 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334		R4GN57	208 aa		3.76	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334		A0A087WW49	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334		A0A087X002	238 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	NR5A2	O00482	541 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	FPGT	O14772	594 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	EPHB6	O15197	1021 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	SNX3	O60493	162 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GLRA3	O75311	464 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	IGLV1-44	P01699	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TCF4	P15884	667 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CLDN15	P56746	228 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	DLK1	P80370	383 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM187	Q14656	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	XKR6	Q5GH73	641 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	OR4A47	Q6IF82	309 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	VSIG1	Q86XK7	387 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	LACC1	Q8IV20	430 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	NSMAF	Q92636	917 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GBP5	Q96PP8	586 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	EGFL8	Q99944	293 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	FGF22	Q9HCT0	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CACNG5	Q9UF02	275 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CCDC188	H7C350	402 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CCL24	O00175	119 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GAS8-AS1	O95177	125 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ALDH1B1	P30837	517 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	HSD17B3	P37058	310 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PRKCI	P41743	596 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MTCP1	P56278	107 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TUBB2A	Q13885	445 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TEAD2	Q15562	447 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PTGIS	Q16647	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ZFP69	Q49AA0	526 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	G2E3	Q7L622	706 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	MAGED4	Q96JG8	741 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	C4orf45	Q96LM5	186 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBM39-231	ENST00000477334	THAP2	Q9H0W7	228 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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