RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475078.1

SZRD1-206, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-206	ENST00000475078	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	SVIL	O95425	2214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MATN4	O95460	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LDLR	P01130	860 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	FGG	P02679	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ATP5D	P30049	168 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	KCNJ1	P48048	391 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	KLC1	Q07866	573 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	C5orf34	Q96MH7	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LHPP	Q9H008	270 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078		H3BMM5	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	PFDN6	O15212	129 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CLDN1	O95832	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ESR1	P03372	595 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ACPP	P15309	386 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TPSB2	P20231	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CMPK1	P30085	196 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TERF1	P54274	439 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CDK16	Q00536	496 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	OCA2	Q04671	838 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078		Q0VFX4	171 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	GBX1	Q14549	363 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	C10orf90	Q96M02	699 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TCF12	Q99081	682 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078		E5RI56	91 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	AVIL	O75366	819 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ERG	P11308	486 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CHRM3	P20309	590 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	CDC16	Q13042	620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SZRD1-206	ENST00000475078	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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