RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	SP3	Q02447	781 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TEAD2	Q15562	447 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230		Q6ZSR9	355 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PTER	Q96BW5	349 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF653	Q96CK0	615 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KLF11	O14901	512 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	DFFB	O76075	338 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	STARD3NL	O95772	234 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PTPN3	P26045	913 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IL11RA	Q14626	422 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SYT14P1	Q58G82	188 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NUDT13	Q86X67	352 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RAD9A	Q99638	391 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PPM1	405 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MEIS2	O14770	477 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LINGO3	P0C6S8	592 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PFKFB1	P16118	471 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MPZ	P25189	248 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	LMAN1	P49257	510 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	UBXN2A	P68543	259 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HSPB3	Q12988	150 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	BECN1	Q14457	450 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	CA9	Q16790	459 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SUSD6	Q92537	303 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	WBP1	Q96G27	269 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PPE2	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PR64	198 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MNDA	P41218	407 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MTHFR	P42898	656 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	UGP2	Q16851	508 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NFU1-209	ENST00000474230	ODF4	Q2M2E3	257 aa		4.37	□□□□□ -1.71

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