RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462970.5

PSMD4-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 4, human

TSL 5

Gene PSMD4, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD4-208	ENST00000462970	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	DTX1	Q86Y01	620 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CT55	Q8WUE5	264 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	EXT2	Q93063	718 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC138	Q96M89	665 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CYTH2	Q99418	400 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	STARD5	Q9NSY2	213 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	EURL	Q9NYK6	297 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CROT	Q9UKG9	612 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PADI1	Q9ULC6	663 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970		E7ENX8	843 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ZNF749	O43361	778 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NRP2	O60462	931 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	INHBA	P08476	426 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CCDC166	P0CW27	439 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TCN2	P20062	427 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ALAS2	P22557	587 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ECHS1	P30084	290 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	GMPR	P36959	345 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	STAT5A	P42229	794 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	RAB10	P61026	200 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TBPL1	P62380	186 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CYP4F2	P78329	520 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TAP2	Q03519	686 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ABHD18	Q0P651	414 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	GPS2	Q13227	327 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CSHL1	Q14406	222 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SLC9A5	Q14940	896 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	MROH9	Q5TGP6	573 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ICE2	Q659A1	982 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	C16orf46	Q6P387	395 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CYS1	Q717R9	158 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	GPR22	Q99680	433 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NDC1	Q9BTX1	674 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SPRY4	Q9C004	299 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	IL17B	Q9UHF5	180 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SNX7	Q9UNH6	387 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ESPN	B1AK53	854 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970		H7BY64	318 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CTSV	O60911	334 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FKBP9	O95302	570 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	C1QA	P02745	245 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	STATH	P02808	62 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	HBQ1	P09105	142 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM153B	P0C7A2	387 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	ERG	P11308	486 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	MSH2	P43246	934 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	AP1S2	P56377	157 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	DNASE1L3	Q13609	305 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	MAP7	Q14244	749 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	NAA25	Q14CX7	972 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FAM153C	Q494X1	144 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	C17orf64	Q86WR6	236 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PSMD4-208	ENST00000462970	PLD3	Q8IV08	490 aa		9.22	□□□□□ -0.93

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