RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETNK2Q9NVF9 386 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EHD3Q9NZN3 535 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMFRQ9UKV5 643 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS4AQ9UN37 437 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERVW-1Q9UQF0 538 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.35□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TJP3O95049 919 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCA5LO95447 670 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABRG2P18507 467 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCKDHBP21953 392 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTNR1AP48039 350 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNA12Q03113 381 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRT81Q14533 505 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 POM121L1PQ3SYA9 428 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GXYLT1Q4G148 440 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LNX2Q8N448 690 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPWQ8N729 165 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMCESQ96FZ2 354 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABRG3Q99928 467 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM31Q9BZY9 425 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM245Q9H330 911 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD248Q9HCU0 757 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF711Q9Y462 761 aa8.34□□□□□ -1.07
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOCS3O95396 460 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARF5P84085 180 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED22Q15528 200 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC73Q6P1J9 531 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA1328Q86T90 577 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 STK40Q8N2I9 435 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYT8Q8NBV8 401 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.33□□□□□ -1.08
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP29Q9HBJ7 922 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DKK3Q9UBP4 350 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.33□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF292O60281 2723 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUMA1Q14980 2115 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ILVBLA1L0T0 632 aa8.32□□□□□ -1.08
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