RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 NXNL1Q96CM4 212 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP3K3Q99759 626 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 BATF3Q9NR55 127 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TLDC2A0PJX2 215 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 E7ENX8 843 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ANXA5P08758 320 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TFEBP19484 476 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IMPA1P29218 277 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LSP1P33241 339 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GMPRP36959 345 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IRF9Q00978 393 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TAP2Q03519 686 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 AGTRAPQ6RW13 159 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB11FIP2Q7L804 512 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LCA5Q86VQ0 697 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PTERQ96BW5 349 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PITPNM3Q9BZ71 974 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EURLQ9NYK6 297 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF112Q9ULX5 631 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0J9YY10 115 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP3K7O43318 606 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GUCA1CO95843 209 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EZRP15311 586 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT15P19012 456 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PAX7P23759 505 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCND1P24385 295 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LSSP48449 732 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL4DP49703 201 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HNMTP50135 292 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf72Q14CZ0 275 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TGFBIQ15582 683 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4D1Q15615 310 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CROCCP2Q86T23 111 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IQCKQ8N0W5 287 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO39Q8N4B4 442 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF248Q8NDW4 579 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RHEBL1Q8TAI7 183 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MZB1Q8WU39 189 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL8AQ96BM9 186 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 EGFL8Q99944 293 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ALG9Q9H6U8 611 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PPV9 198 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SYCE1LA8MT33 242 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 KERAO60938 352 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNDBP1O95273 360 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 S100BP04271 92 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 RBP1P09455 135 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NELFEP18615 380 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVPABLB-1P60509 514 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 HSD11B2P80365 405 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TLE3Q04726 772 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 NAA25Q14CX7 972 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC14AQ86T13 490 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP4X1Q8N118 509 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR78Q96P69 363 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PLD2O14939 933 aa10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms