RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOPNLQ96NB1 174 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKP4Q99569 1192 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EBPLQ9BY08 206 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTN4Q9HB63 628 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRE2Q9UHX3 823 aa18.14■□□□□ 0.5
NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7ESM1 405 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCR6O00574 342 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS23O95084 383 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELP6Q0PNE2 266 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENPP6Q6UWR7 440 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR180Q86V85 440 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALHM3Q86XJ0 350 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MICU2Q8IYU8 434 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C7orf61Q8IZ16 206 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR52E4Q8NGH9 312 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR56A3Q8NH54 315 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUS1Q96E22 293 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB16Q96NS5 453 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UGT2B28Q9BY64 529 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.14■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0YIV9 168 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BM21 787 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPK1AO00322 258 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLK4O00444 970 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCELO95171 688 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSNP06396 782 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRPS1L1P21108 318 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNF4AP41235 474 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN2CP42773 168 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRIP1P48552 1158 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR1H2P55055 460 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDH1Q08174 1060 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL7AQ4VC05 210 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRHL2Q6ISB3 625 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf111Q8N326 155 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO30Q8TB52 745 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3GL3Q99963 347 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRB5O75023 590 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCNAP12004 261 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6P13671 934 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADRB3P13945 408 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GZMMP51124 257 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTAPQ13126 283 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADRM1Q16186 407 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKG7Q16617 165 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4F3Q6IEY1 312 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBPL2Q6SJ96 375 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF765Q7L2R6 523 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT12Q8IV01 421 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCD2Q92925 531 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAUS8Q9BT25 410 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2AG1Q9H205 316 aa18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA3P07451 260 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIR3DL1P43629 444 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPM6BQ13491 265 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF234Q14588 700 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAET1GQ6H3X3 334 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYGBQ8WWM9 190 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM162AQ96A26 154 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM129BQ96TA1 746 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD320Q9NPF0 282 aa18.12■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFXANKO14593 260 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRMT3O60678 531 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf105O95561 183 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RETP07949 1114 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR1P46091 355 aa18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSAMPQ13449 338 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms