RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 C12orf40Q86WS4 652 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 RAB43Q86YS6 212 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 ESX1Q8N693 406 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 MAP6Q96JE9 813 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 RTKNQ9BST9 563 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 ACTR8Q9H981 624 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
ACTBP13-201ENST00000423971 A0A087X1B8 175 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM38O00635 465 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ANGPT2O15123 496 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ALX3O95076 343 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 IGLV3-27P01718 113 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 GBAP04062 536 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TIE1P35590 1138 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PSME3P61289 254 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 BNIP2Q12982 314 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 BCL2A1Q16548 175 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 RAET1GQ6H3X3 334 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SZRD1Q7Z422 152 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD46Q86W74 232 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LEMD2Q8NC56 503 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 APOL4Q9BPW4 351 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 C1orf21Q9H246 121 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PLAGL1Q9UM63 463 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CORINQ9Y5Q5 1042 aa8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LINC01565O15544 149 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 NRP2O60462 931 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PGLSO95336 258 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 HSMCR30P0CW71 290 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 RRM2P31350 389 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TTPAP49638 278 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 HTR6P50406 440 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 P2RX3P56373 397 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 NKX3-2P78367 333 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 GNA13Q14344 377 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP51A1Q16850 503 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ADCK2Q7Z695 626 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SPARTQ8N0X7 666 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LSMEM2Q8N112 164 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR156Q8NFN8 814 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ENKURQ8TC29 256 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 COPS8Q99627 209 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM92AA1XBS5 289 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PLD2O14939 933 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 GRID2O43424 1007 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP7B1O75881 506 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ELFN1P0C7U0 828 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PPP3CCP48454 512 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 USP45Q70EL2 814 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LPGAT1Q92604 370 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LRCH3Q96II8 777 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ALPK1Q96QP1 1244 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 COPS4Q9BT78 406 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PDFQ9HBH1 243 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 FANCFQ9NPI8 374 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LAMA1P25391 3075 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TTC28Q96AY4 2481 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SCO1O75880 301 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LDLRP01130 860 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 APOA4P06727 396 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF806P0C7X5 589 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CD1DP15813 335 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CD247P20963 164 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms