RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCEMP1Q8IX19 187 aa12.56□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2L3Q8NG85 312 aa12.56□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELTQ969Z4 430 aa12.56□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRT6Q8N6T7 355 aa12.54□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A1Q8NGT9 310 aa12.54□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATG4AQ8WYN0 398 aa12.54□□□□□ -0.4
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IDSB3KWA1 339 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7EVH7 732 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRHP07919 91 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCR2P25025 360 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNFP41002 786 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSG2Q14126 1118 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA25Q14CX7 972 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRTGQ2VWP7 1150 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFRALQ6UXV0 394 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAPTM4BQ86VI4 370 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACRBPQ8NEB7 543 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MVB12AQ96EY5 273 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOPNLQ96NB1 174 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PANX2Q96RD6 677 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf105Q9NVL8 296 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIC8BQ9NVN3 520 aa12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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