RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409531.5

TSPAN4-208, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-208ENST00000409531 NUDCD3Q8IVD9 361 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PPFIBP2Q8ND30 876 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 MGARPQ8TDB4 240 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 NXPE2Q96DL1 559 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 HAUS8Q9BT25 410 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SGPP1Q9BX95 441 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 RAB33BQ9H082 229 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 HRASLS2Q9NWW9 162 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 AK5Q9Y6K8 562 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 IGF2RP11717 2491 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 GSAPA4D1B5 854 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ISM1B1AKI9 464 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 K7EPI3 171 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 BTN3A3O00478 584 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 WDR47O94967 919 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CCNDBP1O95273 360 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 FKBP9O95302 570 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TYRP1P17643 537 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 OAS2P29728 719 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 AGTR2P50052 363 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 WDR4P57081 412 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 OR1D5P58170 312 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CFAP157Q5JU67 520 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SUSD1Q6UWL2 747 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 LCTLQ6UWM7 567 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 MDM1Q8TC05 714 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 RSC1A1Q92681 617 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PYCR2Q96C36 320 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TWSG1Q9GZX9 223 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZMYND15Q9H091 742 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 EPHA6Q9UF33 1036 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.94■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 D6RAR5 112 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 KATNA1O75449 491 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CHN1P15882 459 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 EPB42P16452 691 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SQSTM1Q13501 440 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 NAA25Q14CX7 972 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PDK4Q16654 411 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TMEM74Q96NL1 305 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 TMEM237Q96Q45 408 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 MECRQ9BV79 373 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 STK38LQ9Y2H1 464 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.93■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 A0A1W2PPV9 198 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 E2F3O00716 465 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SUPT7LO94864 414 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CPNE6O95741 557 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CD1CP29017 333 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 SERPINB5P36952 375 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 GDF5P43026 501 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 LSSP48449 732 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 NAGLUP54802 743 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 ABATP80404 500 aa15.92■□□□□ 0.14
TSPAN4-208ENST00000409531 CDC16Q13042 620 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms