RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 ACAT2Q9BWD1 397 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 BRINP2Q9C0B6 783 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 PCED1AQ9H1Q7 454 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 C1orf109Q9NX04 203 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 TAC3Q9UHF0 121 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa28.45■■■□□ 2.15
LMO2-202ENST00000395833 H0YIV9 168 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 AXIN1O15169 862 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PCNAP12004 261 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CD27P26842 260 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SMU1Q2TAY7 513 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MMEL1Q495T6 779 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 WASH2PQ6VEQ5 465 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ZFAND4Q86XD8 727 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 FUNDC1Q8IVP5 155 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 FAM174AQ8TBP5 190 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 NPAS2Q99743 824 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 THTPAQ9BU02 230 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB11Q9BUY7 163 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 XKR8Q9H6D3 395 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 EFCAB1Q9HAE3 211 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 WASH6PQ9NQA3 447 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa28.45■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 EML2O95834 649 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ZNF33BQ06732 778 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ART3Q13508 389 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PAGE2BQ5JRK9 111 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MED27Q6P2C8 311 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 KYQ8NBH2 561 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CADM4Q8NFZ8 388 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 OR52E1Q8NGJ3 308 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 WDR20Q8TBZ3 569 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SLC45A3Q96JT2 553 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PCBD2Q9H0N5 130 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 EHD1Q9H4M9 534 aa28.44■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SERTM1A2A2V5 107 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 C9JVG2 144 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CDH1P12830 882 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PKLRP30613 574 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 RAB28P51157 221 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 GRIK2Q13002 908 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 FZD2Q14332 565 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ZNF542PQ5EBM4 170 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 REP15Q6BDI9 236 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CYP20A1Q6UW02 462 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 C16orf89Q6UX73 402 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 C17orf64Q86WR6 236 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 RNF175Q8N4F7 328 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 REPS1Q96D71 796 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 WDR34Q96EX3 536 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 GPR27Q9NS67 375 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ZIM2Q9NZV7 527 aa28.43■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 KDM1AO60341 852 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 G6PDP11413 515 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 UFM1P61960 85 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 E2F2Q14209 437 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 LPCAT2Q7L5N7 544 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 NRROSQ86YC3 692 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 DEFB107AQ8IZN7 70 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 LRP4O75096 1905 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 SLC22A3O75751 556 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ZXDAP98168 799 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 LAPTM5Q13571 262 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CACHD1Q5VU97 1274 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 DSELQ8IZU8 1212 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 LINC01555Q8NAE3 123 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 OR7G3Q8NG95 312 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 OR2L8Q8NGY9 312 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CXorf40BQ96DE9 158 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CMTM7Q96FZ5 175 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 IER2Q9BTL4 223 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 GSDMCQ9BYG8 508 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CAAP1Q9H8G2 361 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 CD320Q9NPF0 282 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 ICKQ9UPZ9 632 aa28.42■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 PIPSLA2A3N6 862 aa28.41■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 K7ESF4 209 aa28.41■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MAP3K13O43283 966 aa28.41■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 NDUFS1P28331 727 aa28.41■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 FAM13CQ8NE31 585 aa28.41■■■□□ 2.14
LMO2-202ENST00000395833 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms