RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390435.1

TRAV8-3-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 8-3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV8-3, Length 341 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAP2K7O14733 419 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TM4SF5O14894 197 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PLIN3O60664 434 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CSO75390 466 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CRCPO75575 148 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 MLYCDO95822 493 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 C9P02748 559 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PROCP04070 461 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 THRAP10827 490 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCKBRP32239 447 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CSF2RBP32927 897 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GMPRP36959 345 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SEPHS1P49903 392 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCR8P51685 355 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CCNG1P51959 295 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GFERP55789 205 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 HSD11B2P80365 405 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 NFKB2Q00653 900 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ACY1Q03154 408 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TAP2Q03519 686 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 LAPTM5Q13571 262 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GRB7Q14451 532 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM164Q5U3C3 297 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FAM129CQ86XR2 697 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 NUDCD3Q8IVD9 361 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GPR135Q8IZ08 494 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 KRT78Q8N1N4 520 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TEX9Q8N6V9 391 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TTLQ8NG68 377 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR2L3Q8NG85 312 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 DLG3Q92796 817 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 UBE2E3Q969T4 207 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZBTB9Q96C00 473 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PYCR2Q96C36 320 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 REPS1Q96D71 796 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TCTN2Q96GX1 697 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GPR78Q96P69 363 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR2A14Q96R47 310 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAP3K3Q99759 626 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SGPP1Q9BX95 441 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CD244Q9BZW8 370 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 OGFRQ9NZT2 677 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 COPG2Q9UBF2 871 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SNX7Q9UNH6 387 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PTPRBP23467 1997 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 KNTC1P50748 2209 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM120BA0PK00 339 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 KRT87PA6NCN2 255 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TXNDC9O14530 226 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TRIM13O60858 407 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SUPT7LO94864 414 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 OTCP00480 354 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 CDH1P12830 882 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAGP20916 626 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 MPSTP25325 297 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PSMB5P28074 263 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GGT5P36269 586 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC6A12P48065 614 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 RAB15P59190 212 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 HERVK_113P63132 956 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PPP2R2AP63151 447 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 IRF8Q02556 426 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FOXM1Q08050 763 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FOXC1Q12948 553 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GTF2H2Q13888 395 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 ISXQ2M1V0 245 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 XKR6Q5GH73 641 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.34□□□□□ -1.23
TRAV8-3-201ENST00000390435 TRIM73Q86UV7 250 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms