RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388948.7

LRRK1-201, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LRRK1, Length 7,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-201ENST00000388948 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 INMTO95050 263 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PCSK2P16519 638 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OTX2P32243 289 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ZMYND11Q15326 602 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TTMPQ5BVD1 217 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CEP97Q8IW35 865 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CST11Q9H112 138 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SDC3O75056 442 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF217O75362 1048 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SHMT2P34897 504 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OSTM1Q86WC4 334 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 A0A1W2PQU0 124 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 BTN3A3O00478 584 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 BCKDKO14874 412 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 NUDT17P0C025 328 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TTKP33981 857 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 KLF10Q13118 480 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MEIOBQ8N635 442 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ASPNQ9BXN1 380 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 H3BUI4 141 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 GPAT4Q86UL3 456 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 RAB7BQ96AH8 199 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TP53I11O14683 189 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MT-ND1P03886 318 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 FAM163BP0C2L3 166 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 RAB28P51157 221 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 DLG1Q12959 904 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 COL21A1Q96P44 957 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ABCC6O95255 1503 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 NTSR1P30989 418 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 IL18Q14116 193 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SLC51AQ86UW1 340 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF516Q92618 1163 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 USP29Q9HBJ7 922 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CIB4A0PJX0 185 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 VIPR2P41587 438 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MAGEA11P43364 429 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ID2Q02363 134 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ECH1Q13011 328 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 BRF2Q9HAW0 419 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 UPB1Q9UBR1 384 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 A0A0X1KG70 313 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OR6C74A6NCV1 312 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 HCRTO43612 131 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 AP2A2O94973 939 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 UNC5CO95185 931 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 VBP1P61758 197 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PLP2Q04941 152 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 HM13Q8TCT9 377 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 GIPC3Q8TF64 312 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MARCH7Q9H992 704 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CBSLP0DN79 551 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CBSP35520 551 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 CTBP2P56545 445 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 REP15Q6BDI9 236 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 JAM2P57087 298 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 MFSD5Q6N075 450 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ARL10Q8N8L6 244 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PTCHD1Q96NR3 888 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 LRP8Q14114 963 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 UPP1Q16831 310 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRK1-201ENST00000388948 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms