RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GANQ9H2C0 597 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CPVLQ9H3G5 476 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 VCPKMTQ9H867 229 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 C6orf50Q9HD87 102 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa3.45□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 TRAPPC3O43617 180 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 FAM107AO95990 144 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G4BP0C869 781 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 TMOD1P28289 359 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GNA11P29992 359 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 CCDC40Q4G0X9 1142 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 ATG16L1Q676U5 607 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 TLCD1Q96CP7 247 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC39A13Q96H72 371 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TSG101Q99816 390 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PANK4Q9NVE7 773 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.44□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 E9PMD0 336 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 H0YHG0 523 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRK-202ENST00000368205 KCNN4O15554 427 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 PPIP5K2O43314 1243 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 SLC37A4O43826 429 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 MGRN1O60291 552 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 ZFAND5O76080 213 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 TDP2O95551 362 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 GNA14O95837 355 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 LDHCP07864 332 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC172P0C7W6 258 aa3.43□□□□□ -1.86
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