RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SERTM1A2A2V5 107 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC14BA6NHZ5 514 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PPM1DO15297 605 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 WFS1O76024 890 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GDF5P43026 501 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 RELAQ04206 551 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TRAF3Q13114 568 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SQSTM1Q13501 440 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LAPTM5Q13571 262 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TAF11Q15544 211 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LPAL2Q16609 132 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ATG9BQ674R7 924 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CUZD1Q86UP6 607 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SNX32Q86XE0 403 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CARFQ8N187 725 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MINDY1Q8N5J2 469 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PATE1Q8WXA2 126 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR4K3Q96R72 315 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SRMSQ9H3Y6 488 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NT5DC2Q9H857 520 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 IL21RQ9HBE5 538 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NCOR1O75376 2440 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 LNP1A1A4G5 178 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KRT87PA6NCN2 255 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OR5K3A6NET4 321 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GIPC1O14908 333 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 HGSO14964 777 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GPR37O15354 613 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CLDN9O95484 217 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 UROSP10746 265 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 HNF4AP41235 474 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CCNG1P51959 295 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 CDH13P55290 713 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SH3BP2P78314 561 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GPLD1P80108 840 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NR0B2Q15466 257 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KANK2Q63ZY3 851 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 OOSP2Q86WS3 158 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SLC35F3Q8IY50 421 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 KYQ8NBH2 561 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ESAMQ96AP7 390 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PYCR2Q96C36 320 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 MED8Q96G25 268 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 IL17FQ96PD4 163 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SARGQ9BW04 601 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF225Q9UK10 706 aa5.69□□□□□ -1.5
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