RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 VLDLRP98155 873 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 SCRN2Q96FV2 425 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 CEP295NLQ96MC4 621 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 CLIC1O00299 241 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FUCA1P04066 466 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 TUBA3CQ13748 450 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 DGCR6Q14129 220 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 DCDC5Q6ZRR9 648 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ASB11Q8WXH4 323 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 B4GALT6Q9UBX8 382 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM202A6NGA9 273 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 OR2AG2A6NM03 316 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 WNT9AO14904 365 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 NUDT7P0C024 238 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 CD22P20273 847 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 AQP1P29972 269 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 RAD23AP54725 363 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 PHEXP78562 749 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ABHD18Q0P651 414 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ABRQ12979 859 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 SYT12Q8IV01 421 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM169Q96HH4 297 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 RASSF1Q9NS23 344 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 BLOC1S6Q9UL45 172 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 NDUFS2O75306 463 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FKBP9O95302 570 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 OCM2P0CE71 109 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 KIR3DL1P43629 444 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 EPS8Q12929 822 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 UGT8Q16880 541 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 TPGS2Q68CL5 300 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FKBP9P1Q75LS8 142 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 HIPK1Q86Z02 1210 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FAR1Q8WVX9 515 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 MAGIXQ9H6Y5 334 aa24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 AGAP14A8MT82 685 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 OR56A5P0C7T3 313 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 PRPS2P11908 318 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 HLA-FP30511 346 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FRG2Q64ET8 278 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 TPD52L3Q96J77 140 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 COX4I2Q96KJ9 171 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FRG2BQ96QU4 278 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
HOXB3-201ENST00000311626 FPGSQ05932 587 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 GBX1Q14549 363 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 Q6ZVU0 165 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 IGFN1Q86VF2 1251 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 BRD9Q9H8M2 597 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1W2PRU2 124 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 EVPLLA8MZ36 301 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 IDUAP35475 653 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 SLC6A12P48065 614 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 CTF1Q16619 201 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 CCSMST1Q4G0I0 132 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 OR2T5Q6IEZ7 315 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 USP45Q70EL2 814 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 OR52E4Q8NGH9 312 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 OR2T29Q8NH02 315 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 CFAP99D6REC4 459 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 KCNK5O95279 499 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 COX7A2P14406 83 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 CD6P30203 668 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 TGFBR1P36897 503 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 NPTX1Q15818 432 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 NDNFQ8TB73 568 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 ELMO1Q92556 727 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 NELL1Q92832 810 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 MAL2Q969L2 176 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXB3-201ENST00000311626 MAGED4Q96JG8 741 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms