RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 TSPAN3O60637 253 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PRKCDQ05655 676 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PLD4Q96BZ4 506 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NELFAQ9H3P2 528 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZNF20P17024 532 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CD47Q08722 323 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 LSAMPQ13449 338 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PPM1JQ5JR12 505 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GALNT7Q86SF2 657 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PYURFQ96I23 114 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MAGEH1Q9H213 219 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PHF24Q9UPV7 400 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ASF1AQ9Y294 204 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD63C9JTQ0 380 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HTR2BP41595 481 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CDT1Q9H211 546 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FAM159BA6NKW6 160 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RGS19P49795 217 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HK1P19367 917 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MYF6P23409 242 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MED31Q9Y3C7 131 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MYO7AQ13402 2215 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 BTBD19C9JJ37 291 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FOSL1P15407 271 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 IL7RP16871 459 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CTPS1P17812 591 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 WDR4P57081 412 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CRY2Q49AN0 593 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SLC30A6Q6NXT4 461 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HACD2Q6Y1H2 254 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 A0A1B0GUL6 1792 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PIAS1O75925 651 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR2B3O76000 313 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DGKGP49619 791 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ACTA2P62736 377 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ACTG2P63267 376 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DPF3Q92784 378 aa16.54■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 LRRTM2O43300 516 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 FAM155BO75949 473 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 LGALS2P05162 132 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 TNFRSF25Q93038 417 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CEP290O15078 2479 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 IL1BP01584 269 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 KLRC2P26717 231 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MAPK14Q16539 360 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 MBLAC2Q68D91 279 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SMARCD3Q6STE5 483 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ING5Q8WYH8 240 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 IFNA1P01562 189 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ZNF487B1APH4 448 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NCK1P16333 377 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ARSFP54793 590 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SOX10P56693 466 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 ABHD18Q0P651 414 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.53■□□□□ 0.24
HCN1-201ENST00000303230 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms