RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 SPINT1O43278 529 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GSNP06396 782 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PRPS1L1P21108 318 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PTPN6P29350 595 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MTHFRP42898 656 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CCSMST1Q4G0I0 132 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GPR149Q86SP6 731 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SYT12Q8IV01 421 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HERVK_113Q902F9 699 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.24■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SNAP29O95721 258 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 B3GALT4O96024 378 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 RETP07949 1114 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HNF4AP41235 474 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CDKN2CP42773 168 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 KIR3DL1P43629 444 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 METAP1P53582 386 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 NKG7Q16617 165 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ZFP28Q8NHY6 868 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PTTG2Q9NZH5 202 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 VPS29Q9UBQ0 182 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 RFXANKO14593 260 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PRMT3O60678 531 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ITGB7P26010 798 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 IMPA1P29218 277 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 VIPR2P41587 438 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 GZMMP51124 257 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MTAPQ13126 283 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OR4F3Q6IEY1 312 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PKP4Q99569 1192 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa23.23■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MYO7AQ13402 2215 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 H0YIV9 168 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CLIC3O95833 236 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SLC16A8O95907 504 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ALDH3B2P48448 385 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ALDH3A2P51648 485 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ARSFP54793 590 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MESP2Q0VG99 397 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OFCC1Q8IZS5 231 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OR56A3Q8NH54 315 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OR4K3Q96R72 315 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 DNAJB9Q9UBS3 223 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 LRRK1Q38SD2 2015 aa23.22■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PRRT4C9JH25 899 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CREG1O75629 220 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 BMP10O95393 424 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SOD1P00441 154 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HLA-EP13747 358 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PDHA2P29803 388 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 CDH15P55291 814 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 DAG1Q14118 895 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 BCL7AQ4VC05 210 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 NLRP8Q86W28 1048 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 C10orf111Q8N326 155 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 OR8D1Q8WZ84 308 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ARRDC3Q96B67 414 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 THEGQ9P2T0 379 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 H3BM21 787 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 NPC1O15118 1278 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PRKD3O94806 890 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ALBP02768 609 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HSD3B1P14060 373 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 HSD3B2P26439 372 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PCDH1Q08174 1060 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ABHD18Q0P651 414 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 ELP6Q0PNE2 266 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 LSAMPQ13449 338 aa23.21■■□□□ 1.31
TRIM54-201ENST00000296098 PON2Q15165 354 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms