RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265560.8

USP4-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP4, Length 3,126 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-201ENST00000265560 RIPK1Q13546 671 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 KRT33BQ14525 404 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 GSTA3Q16772 222 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TTC23LQ6PF05 361 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 C16orf89Q6UX73 402 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 HID1Q8IV36 788 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CDH1P12830 882 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 JUPP14923 745 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 MAOBP27338 520 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC7A2P52569 658 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 IFNEQ86WN2 208 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 C1orf109Q9NX04 203 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.95■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CCDC154A6NI56 674 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 LRRC72A6NJI9 287 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 BCKDHAP12694 445 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 MTTPP55157 894 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 MAPRE2Q15555 327 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 STMN2Q93045 179 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 BIRC7Q96CA5 298 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PPP3R2Q96LZ3 170 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TMEM74Q96NL1 305 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 FANCMQ8IYD8 2048 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC28A1O00337 649 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 BAG2O95816 211 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TGFB1P01137 390 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ACADVLP49748 655 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CYP4F2P78329 520 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 KIAA0040Q15053 153 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RABL3Q5HYI8 236 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 Q6ZSR6 202 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ANKRD46Q86W74 232 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OR13H1Q8NG92 308 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OR7G3Q8NG95 312 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 FBRSQ9HAH7 460 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SCML1Q9UN30 329 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 FEZF1A0PJY2 475 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 IGHV4-34P06331 123 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CTBSQ01459 385 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CCNIQ14094 377 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PIGGQ5H8A4 983 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OXR1Q8N573 874 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 LINC01555Q8NAE3 123 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TSTD1Q8NFU3 115 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PATE1Q8WXA2 126 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 USP22Q9UPT9 525 aa15.94■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 TTC28Q96AY4 2481 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RGS19P49795 217 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ATP4BP51164 291 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 OR51B5Q9H339 312 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 CROTQ9UKG9 612 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 SPTBP11277 2137 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 H7BY64 318 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ANKRD28O15084 1053 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 PSMG1O95456 288 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 DGKEP52429 567 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 ACTR3P61158 418 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 NFYCQ13952 458 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 RCAN2Q14206 197 aa15.93■□□□□ 0.14
USP4-201ENST00000265560 C6orf163Q5TEZ5 329 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms