RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 TBC1D20Q96BZ9 403 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 WWOXQ9NZC7 414 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 SPG21Q9NZD8 308 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 GMPPBQ9Y5P6 360 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.02■■□□□ 1.44
LMO2-201ENST00000257818 WDR47O94967 919 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 C1QCP02747 245 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 URODP06132 367 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 HOXA9P31269 272 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TGFBR2P37173 567 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 OR2T5Q6IEZ7 315 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PRSS48Q7RTY5 328 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PAGE2Q7Z2X7 111 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SCAIQ8N9R8 606 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 OR2T29Q8NH02 315 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 USP7Q93009 1102 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PLD4Q96BZ4 506 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 LGALS12Q96DT0 336 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CORO1BQ9BR76 489 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PRSS21Q9Y6M0 314 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RGS10O43665 173 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ZNF682O95780 498 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CD40LGP29965 261 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RAB33AQ14088 237 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PYCR2Q96C36 320 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 DSN1Q9H410 356 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ZBBXA8MT70 800 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 WNT9AO14904 365 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 DIRAS1O95057 198 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 VEPH1Q14D04 833 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 LINGO4Q6UY18 593 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 C16orf59Q7L2K0 433 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RHOXF1Q8NHV9 184 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 UBE2FQ969M7 185 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 NTMT1Q9BV86 223 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ACPTQ9BZG2 426 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 MYO1GB0I1T2 1018 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CD160O95971 181 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ABHD18Q0P651 414 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SELENBP1Q13228 472 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 KCNJ8Q15842 424 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SERPINA9Q86WD7 417 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CLDN19Q8N6F1 224 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 DNAJB8Q8NHS0 232 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CLPBQ9H078 707 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RMND5AQ9H871 391 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 IL1RAPQ9NPH3 570 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TMED5Q9Y3A6 229 aa24■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 MYO1DO94832 1006 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 LCKP06239 509 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 RHOCP08134 193 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 EBLN1P0CF75 366 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 LAG3P18627 525 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 KRT20P35900 424 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 FAM151BQ6UXP7 276 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TM9SF3Q9HD45 589 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PPT2Q9UMR5 302 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 OR2A25A4D2G3 310 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 FAM20BO75063 409 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 TIMP1P01033 207 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 S100A3P33764 101 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CA8P35219 290 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 PPP5CP53041 499 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 CLDN8P56748 225 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 ARF5P84085 180 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SVOPQ8N4V2 548 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 SLC22A12Q96S37 553 aa23.99■■□□□ 1.43
LMO2-201ENST00000257818 APOL4Q9BPW4 351 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms