RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 LIMS1P48059 325 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 BNC1Q01954 994 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 IFNEQ86WN2 208 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EXD1Q8NHP7 514 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC16A10Q8TF71 515 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATG4AQ8WYN0 398 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLITRK1Q96PX8 696 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 HMG20AQ9NP66 347 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RNF146Q9NTX7 359 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DPP3Q9NY33 737 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 VPS51Q9UID3 782 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RAP2CQ9Y3L5 183 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NESP48681 1621 aa3.58□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PTCH1Q13635 1447 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AIM2O14862 343 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KCNN4O15554 427 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DCXO43602 365 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 VPS26AO75436 327 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 MED24O75448 989 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATP6V1G2O95670 118 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF24P17028 368 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TGFBR2P37173 567 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GABRB2P47870 512 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 E2F1Q01094 437 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LRRC38Q5VT99 294 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TRIQKQ629K1 86 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZNF605Q86T29 641 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CD302Q8IX05 232 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 DNASE1L2Q92874 299 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PRRX2Q99811 253 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ASCL2Q99929 193 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 P2RY12Q9H244 342 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PIGMQ9H3S5 423 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 UPB1Q9UBR1 384 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GMEB1Q9Y692 573 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 UGGT2Q9NYU1 1516 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PTPRTO14522 1441 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EMSYQ7Z589 1322 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TCAF2A6NFQ2 919 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CAPN14A8MX76 684 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM114B3SHH9 223 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PRRG1O14668 218 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GNB5O14775 395 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 HS3ST1O14792 307 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 SLC16A4O15374 487 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ZW10O43264 779 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CDC14BO60729 498 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPS6KA5O75582 802 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CALCAP01258 141 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ENGP17813 658 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ITGB8P26012 769 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 FGL1Q08830 312 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 GNA13Q14344 377 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PTGISQ16647 500 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TCTN1Q2MV58 587 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 TMEM26Q6ZUK4 368 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 NRROSQ86YC3 692 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 KLBQ86Z14 1044 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.57□□□□□ -1.84
LATS1-201ENST00000253339 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms