RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029446.12

Csde1-201, Transcript of Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Csde1, Length 4,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1-201ENSMUST00000029446 Zfp65Q91W94 390 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Q9D3J9 298 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sertad3Q9ERC3 197 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Slc13a2Q9ES88 586 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Htra1Q9R118 480 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 MycsQ9Z304 431 aa6.86□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Itga8A2ARA8 1062 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm10477F6SW83 55 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gm10269G3UWD7 123 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Socs5O54928 536 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cyp2b19O55071 492 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tpst2O88856 376 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Erp29P57759 262 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mapk1P63085 358 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cited1P97769 203 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Kcnc2Q14B80 642 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Hist2h2acQ64523 129 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sdr16c5Q7TQA3 309 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr366Q7TRY4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 SvopQ8BFT9 548 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Timm29Q8BGX2 266 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 PstkQ8BP74 359 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sirt5Q8K2C6 310 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Akr1c21Q91WR5 323 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Elovl6Q920L5 267 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rsl24d1Q99L28 163 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Ly6kQ9CWP4 154 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Efcab1Q9D3N2 212 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 TsaccQ9DA44 124 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 HaghlQ9DB32 283 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Yipf5Q9EQQ2 257 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Abcb9Q9JJ59 762 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gmeb1Q9JL60 562 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 SpastQ9QYY8 614 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Hey1Q9WV93 299 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Dock1Q8BUR4 1865 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 BC025446A0A087WQT1 134 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Zscan4eA0A1B0GRE8 505 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Phf11bB4XVQ1 276 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr564E9PWA8 316 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Herc6F2Z461 1003 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Fbxw9F8VPX2 458 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 H2-T24F8VQG4 363 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Vti1bO88384 232 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 AurkcO88445 282 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 P01648 108 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 P01673 111 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Cd3gP11942 182 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 GhrP16882 650 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 F3P20352 294 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Htr7P32304 448 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rab23P35288 237 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Klf1P46099 358 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 SmoP56726 793 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Fitm2P59266 262 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 MtpnP62774 118 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Gabrb3P63080 473 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Dnal1Q05A62 190 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lpcat1Q3TFD2 534 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 CamkmtQ3U2J5 323 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Lmf1Q3U3R4 574 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sel1l2Q3V172 688 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 EndouQ3V188 412 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 AbrQ5SSL4 859 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr463Q5SW49 311 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr462Q5SW50 311 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Hsd3b5Q61694 373 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tlr12Q6QNU9 906 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tigd3Q7TM95 470 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pex26Q8BGI5 305 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Elmo1Q8BPU7 727 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Clec4a3Q8JZX6 237 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 RorbQ8R1B8 470 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Mterf3Q8R3J4 412 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr1361Q8VFH0 317 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Etfrf1Q91V16 86 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 PrkxQ922R0 355 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Atp6v1c2Q99L60 427 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Alg14Q9D081 217 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Olfr704Q9EPF6 315 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sars2Q9JJL8 518 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Slamf1Q9QUM4 343 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Nufip1Q9QXX8 484 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Sgk2Q9QZS5 367 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Plin4O88492 1403 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Myo16Q5DU14 1919 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Arhgap36B1AUC7 590 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Rnf169E9Q7F2 694 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Pabpc4lG5E8X2 370 aa6.85□□□□□ -1.31
Csde1-201ENSMUST00000029446 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms