RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm19345G3UYD9 124 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il2rgP34902 369 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tm9sf2P58021 662 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dlgap3Q6PFD5 977 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PrlhrQ6VMN6 370 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Svs2Q8BS30 375 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SowahcQ8C0J6 512 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Armcx6Q8K3A6 301 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NotumQ8R116 503 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adap2Q8R2V5 381 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr615Q8VGY4 313 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ms4a10Q99N03 267 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700013H16RikQ9DAC5 291 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cab39lQ9DB16 337 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx59Q9DBN9 619 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChmQ9QXG2 665 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Net1Q9Z206 595 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FryE9Q8I9 3020 aa21.9■■□□□ 1.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r-ps130A0A140T8U3 855 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r24D3YUI0 854 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r7E9PYL5 915 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp607bG3X9H3 648 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rag1P15919 1040 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptgs1P22437 602 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ItgalP24063 1163 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MatkP41242 505 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc12a2P55012 1205 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AbatP61922 500 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PhbP67778 272 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ptpn2Q06180 406 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 H2-M3Q31093 336 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glb1l2Q3UPY5 636 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr12Q60894 333 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift20Q61025 132 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Jak3Q62137 1100 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Galk2Q68FH4 458 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcaf12Q8BGZ3 453 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm9881Q8BR56 211 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gprin3Q8BWS5 763 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Agfg1Q8K2K6 561 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr781Q8VFZ8 311 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SmtnQ921U8 923 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fgf21Q9JJN1 210 aa21.89■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr76A6PWY4 622 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtx3D3YTP3 312 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ikzf3O08900 507 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 St3gal5O88829 414 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt4P07744 525 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pnrc1Q3TWH3 297 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm14226Q3TZL0 686 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Q3UTZ3 580 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tspyl3Q3UYP3 334 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akap14Q3V0I7 536 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CybaQ61462 192 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rcbtb1Q6NXM2 531 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep104Q80V31 926 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HhatQ8BMT9 499 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kcns3Q8BQZ8 491 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr1302Q8VGE9 315 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sec14l2Q99J08 403 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MispQ9D279 648 aa21.88■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm17067E9Q6S4 354 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Neurod4O09105 330 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cbx4O55187 551 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CxadrP97792 365 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psmb4P99026 264 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Serpina6Q06770 397 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akr1clQ3UXL1 322 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trim80Q3V061 624 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf583Q3V080 568 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Glp2rQ5IXF8 512 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11992Q5SS90 291 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mapkap1Q8BKH7 522 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klhl38Q8BSF5 581 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 OsgepQ8BWU5 335 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TiparpQ8C1B2 657 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Snx8Q8CFD4 459 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp45Q8K387 813 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc26a7Q8R2Z3 656 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Otud7aQ8R554 926 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tubg2Q8VCK3 451 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NclnQ8VCM8 563 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MrgprgQ91ZB5 289 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ceacam2Q925P2 520 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc8b1Q925Q3 585 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hint3Q9CPS6 165 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Commd8Q9CZG3 183 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dusp26Q9D700 211 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uba7Q9DBK7 977 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hcar2Q9EP66 360 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt6bQ9Z331 562 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Speer3W4VSP1 261 aa21.87■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa21.86■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr603L7N1Y4 312 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.4 ms