RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPH1P58417 271 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DOC2AQ14183 400 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 XKR6Q5GH73 641 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TREML1Q86YW5 311 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T11Q8NH01 316 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DYRK1BQ9Y463 629 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 VILLO15195 856 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ULK1O75385 1050 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT6AP02538 564 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT6BP04259 564 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 NME1P15531 152 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CD22P20273 847 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PKLRP30613 574 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC19A1P41440 591 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT6CP48668 564 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCCQ15814 346 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 IYDQ6PHW0 289 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZSR9 355 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SMPDL3AQ92484 453 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBGCP3Q96CW5 907 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR34Q96EX3 536 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPER2Q96P56 530 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC61Q9BV99 259 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ICKQ9UPZ9 632 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM1AO60341 852 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 T-ENOLP0DO92 83 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 HNF4AP41235 474 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 GRHL2Q6ISB3 625 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF8Q7Z7C8 310 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf74Q86VG3 221 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 HAUS8Q9BT25 410 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX6Q9UNH7 406 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 THADAQ6YHU6 1953 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPV9 198 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 UBDO15205 165 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf61Q13536 156 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 GAB3Q8WWW8 586 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 HBEGFQ99075 208 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 EHD1Q9H4M9 534 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 XKR8Q9H6D3 395 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMAP2Q9UG22 337 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL27Q9Y4X3 112 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YIV9 168 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CBX6O95503 412 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 LBPP18428 481 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG9BQ674R7 924 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PMS2CLQ68D20 193 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 OGFOD2Q6N063 350 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 MARK4Q96L34 752 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SERTM1A2A2V5 107 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5K4A6NMS3 321 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC28A1O00337 649 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC5CO95185 931 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 PDYNP01213 254 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 VARSP26640 1264 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF10Q13118 480 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPEREQ5SY80 951 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 FRG2Q64ET8 278 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPE4Q6UWF7 544 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-215ENST00000628018 SFRP1Q8N474 314 aa24.04■■□□□ 1.44
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