RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 ZNF233A6NK53 670 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PI4K2BG5E9Z4 385 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PDXKO00764 312 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 RFPL2O75678 378 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 RGS11O94810 467 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 OAZ2O95190 189 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SLU7O95391 586 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CA8P35219 290 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 GP5P40197 560 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PRCPP42785 496 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TUBA4AP68366 448 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ECT2LQ008S8 904 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CYP24A1Q07973 514 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 EFEMP1Q12805 493 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PSMD5Q16401 504 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 COLEC12Q5KU26 742 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CST9LP1Q5W188 147 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SLC8B1Q6J4K2 584 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PET117Q6UWS5 81 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LINGO2Q7L985 606 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 KIF18AQ8NI77 898 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CASP10Q92851 521 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SENP8Q96LD8 212 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 GSDMAQ96QA5 445 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NUDCD1Q96RS6 583 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 HGH1Q9BTY7 390 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 VWA8A3KMH1 1905 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 USP34Q70CQ2 3546 aa5.85□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CITO14578 2027 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ANK1P16157 1881 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LNP1A1A4G5 178 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LOC730098B7Z3J9 87 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TRAPPC3O43617 180 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 DAB1O75553 588 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 AKAP3O75969 853 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SEC24AO95486 1093 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 NR3C1P04150 777 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CBSLP0DN79 551 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TYMPP19971 482 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PTAFRP25105 342 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ACADLP28330 430 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TNFSF8P32971 234 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CBSP35520 551 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CCR3P51677 355 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 UBE2HP62256 183 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 DLG2Q15700 870 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SPATS1Q496A3 300 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 MIDNQ504T8 468 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 WSCD1Q658N2 575 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 IGFL4Q6B9Z1 124 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CENPPQ6IPU0 288 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CEP76Q8TAP6 659 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 LPGAT1Q92604 370 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CDRT15Q96T59 188 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 POMKQ9H5K3 350 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
ATRX-210ENST00000623316 COPG2Q9UBF2 871 aa5.84□□□□□ -1.47
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