RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PGRP06401 933 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC13A2Q13183 592 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SPIN4Q56A73 249 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NEK5Q6P3R8 708 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CMTM6Q9NX76 183 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SPATA2Q9UM82 520 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 M0QZQ0 153 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PRKD3O94806 890 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GRM2Q14416 872 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR153Q6NV75 609 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CYS1Q717R9 158 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GJD3Q8N144 294 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PDLIM1O00151 329 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C4BPBP20851 252 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFS1P28331 727 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DGKEP52429 567 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM171BQ6P995 826 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM74Q96NL1 305 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 FZD4Q9ULV1 537 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 S1PR4O95977 384 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ARSDP51689 593 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RABL3Q5HYI8 236 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 COX18Q8N8Q8 333 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MOCOSQ96EN8 888 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF570Q96NI8 536 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CD244Q9BZW8 370 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMD11O00231 422 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GMFGO60234 142 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXB2P14652 356 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF24P17028 368 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MPIP34949 423 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GMPRP36959 345 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RAPSNQ13702 412 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 S100ZQ8WXG8 99 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RGMAQ96B86 450 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GLDCP23378 1020 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CRISP3P54108 245 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TREML1Q86YW5 311 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP97Q8IW35 865 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5K1Q8NHB7 308 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OR51B5Q9H339 312 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 IRGMA1A4Y4 181 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CDH1P12830 882 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 DIO3P55073 304 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TMC8Q8IU68 726 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 ART5Q96L15 291 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CASKO14936 926 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RCVRNP35243 200 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 KCT2Q8NC54 265 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PIGXQ8TBF5 258 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 C5orf34Q96MH7 638 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 COL21A1Q96P44 957 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A0J9YVX5 310 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 K7ERQ8 282 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 TRMUO75648 421 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5F1O95221 314 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 OPN1SWP03999 348 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 PCDH1Q08174 1060 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SCARB2Q14108 478 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRJ-208ENST00000615445 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms