RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB1P25685 340 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PSEN2P49810 448 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC26A5P58743 744 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 SLC3A1Q07837 685 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DCLK1O15075 740 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MPIP34949 423 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PARP15Q460N3 678 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 ALG3Q92685 438 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PHF24Q9UPV7 400 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MATN4O95460 622 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ALPPL2P10696 532 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 VAMP1P23763 118 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CPT2P23786 658 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BLKP51451 505 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ACTBP60709 375 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ACTG1P63261 375 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2H2Q13888 395 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RABL3Q5HYI8 236 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SPOCK2Q92563 424 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SH3BGRLO75368 114 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ELFN1P0C7U0 828 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PRPS2P11908 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HCAR3P49019 387 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 EFCAB7A8K855 629 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CTBP1Q13363 440 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DET1Q7L5Y6 550 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PHC2Q8IXK0 858 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RDH10Q8IZV5 341 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MALT1Q9UDY8 824 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ATP6AP2O75787 350 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 DHCR24Q15392 516 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GPRC6AQ5T6X5 926 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF529Q6P280 563 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF773Q6PK81 442 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LNX2Q8N448 690 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 STYXQ8WUJ0 223 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SEMA3CQ99985 751 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ITPAQ9BY32 194 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLIT3O75094 1523 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGAP23Q9P227 1491 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 H3BRB1 525 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 COQ9O75208 318 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LIMK2P53671 638 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 MLC1Q15049 377 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PTPRRQ15256 657 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TM9SF4Q92544 642 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 BRD7Q9NPI1 651 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 LATO43561 262 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 ANGPTL7O43827 346 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 KLRC4O43908 158 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 OAZ2O95190 189 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 HMGN1P05114 100 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-209ENST00000612229 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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