RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SFRP1	Q8N474	314 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF382	Q96SR6	550 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	HGH1	Q9BTY7	390 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	MENT	Q9BUN1	341 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC61	Q9BV99	259 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SGPP1	Q9BX95	441 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	12.37	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	PIAS2	O75928	621 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ESRRB	O95718	433 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	OTC	P00480	354 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	EBLN1	P0CF75	366 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ARRB2	P32121	409 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SLC19A1	P41440	591 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CASP2	P42575	452 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	BDKRB1	P46663	353 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	HSPA7	P48741	367 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	PNLIPRP1	P54315	467 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SH3BP2	P78314	561 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CDC16	Q13042	620 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	GTF2H2	Q13888	395 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	KRT33B	Q14525	404 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SMPDL3A	Q92484	453 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CCT7	Q99832	543 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	FAM107B	Q9H098	131 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	UCK1	Q9HA47	277 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		12.36	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	YY2	O15391	372 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SNX3	O60493	162 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	RFPL3	O75679	317 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	EML2	O95834	649 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ALPPL2	P10696	532 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	RAB28	P51157	221 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CDH13	P55290	713 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	DAB2	P98082	770 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF33B	Q06732	778 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	NAE1	Q13564	534 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	LCTL	Q6UWM7	567 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CUZD1	Q86UP6	607 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	NAGS	Q8N159	534 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	TEX9	Q8N6V9	391 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	LMX1A	Q8TE12	382 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	AGAP11	Q8TF27	550 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ESAM	Q96AP7	390 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	HAUS8	Q9BT25	410 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	EHD1	Q9H4M9	534 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		12.35	□□□□□ -0.43
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43

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