RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN33Q86UF1 283 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCHQ86VS3 1027 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LPGAT1Q92604 370 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KAT2AQ92830 837 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CD101Q93033 1021 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP4Q96MN2 994 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FMO2Q99518 471 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM51Q9BSJ1 452 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DPH5Q9H2P9 285 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ACP6Q9NPH0 428 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM153AQ9UHL3 310 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIP11Q15643 1979 aa4.13□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf226A1L170 272 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 GLTPD2A6NH11 291 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PDHXO00330 501 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 OGG1O15527 345 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MED7O43513 233 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK8O60259 260 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM189A1O60320 539 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 GPC4O75487 556 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS6KA5O75582 802 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 GCATO75600 419 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TOMM70O94826 608 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PROSCO94903 275 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NFATC1O95644 943 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXC6P09630 235 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MYZAPP0CAP1 466 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MCF2P10911 925 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PCNAP12004 261 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 P4HA1P13674 534 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ETFAP13804 333 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CTPS1P17812 591 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SRD5A1P18405 259 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DPA1P20036 260 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PROZP22891 400 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 YWHAQP27348 245 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TMOD1P28289 359 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 EPHB2P29323 1055 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 HSD17B3P37058 310 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CCT8P50990 548 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCN5P51795 746 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 BMXP51813 675 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF132P52740 706 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R40P59535 323 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL6P60660 151 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FKBP1BP68106 108 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SCN1BQ07699 218 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP1Q07960 439 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KLF10Q13118 480 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CALCOCO2Q13137 446 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PTK6Q13882 451 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL15Q16663 113 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN26Q16670 478 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TCTN1Q2MV58 587 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SMU1Q2TAY7 513 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TTMPQ5BVD1 217 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SGO1Q5FBB7 561 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NHSL2Q5HYW2 709 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf163Q5TEZ5 329 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 AGBL2Q5U5Z8 902 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DUPD1Q68J44 220 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CNSTQ6PJW8 725 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KDM7AQ6ZMT4 941 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCK2Q7Z695 626 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CROCCP2Q86T23 111 aa4.12□□□□□ -1.75
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