RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1L3Q8NH93 324 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF480Q8WV37 535 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SMPDL3AQ92484 453 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC138Q96M89 665 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GPAMQ9HCL2 828 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PADI1Q9ULC6 663 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 BTRCQ9Y297 605 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF839A8K0R7 811 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF749O43361 778 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SCRG1O75711 98 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN12O95859 305 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CTSBP07858 339 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TCN2P20062 427 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 IMPA1P29218 277 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD17B2P37059 387 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1A2P50993 1020 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PMS2P54278 862 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TLE3Q04726 772 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 NAE1Q13564 534 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 BMPR2Q13873 1038 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLMAPQ14BN4 828 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PHKG1Q16816 387 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH9Q5TGP6 573 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ICE2Q659A1 982 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 RELL1Q8IUW5 271 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR135Q8IZ08 494 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2L3Q8NG85 312 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 OR8K5Q8NH50 307 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PYCR2Q96C36 320 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MED8Q96G25 268 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CYTH2Q99418 400 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR22Q99680 433 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 DPH7Q9BTV6 452 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FANCEQ9HB96 536 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 STARD5Q9NSY2 213 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL15Q9NXU5 204 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 EURLQ9NYK6 297 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 TAC3Q9UHF0 121 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 SPTBP11277 2137 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0J9YVX5 310 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms