RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587662.1

PTPRH-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRH, Length 571 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-205ENST00000587662 SPNS2Q8IVW8 549 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 C10orf90Q96M02 699 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 KDM1AO60341 852 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 FDFT1P37268 417 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 KLC1Q07866 573 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TCTE1Q5JU00 501 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CTSL3PQ5NE16 218 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 OR2L3Q8NG85 312 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PSMF1Q92530 271 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PEX13Q92968 403 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 AGAP4Q96P64 663 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 MIPEPQ99797 713 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SLX1AQ9BQ83 275 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 LHPPQ9H008 270 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CSMD2Q7Z408 3487 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TARM1B6A8C7 271 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 IFNB1P01574 187 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 APOA4P06727 396 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 EFNA3P52797 238 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 GBX1Q14549 363 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ATG9BQ674R7 924 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RNF44Q7L0R7 432 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 LAPTM4BQ86VI4 370 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 FAR1Q8WVX9 515 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ZUFSPQ96AP4 578 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 C8orf44Q96CB5 159 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 BIRC8Q96P09 236 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RBSNQ9H1K0 784 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PDZD2O15018 2839 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 LRRTM2O43300 516 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RPN2P04844 631 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 PRAMEP78395 509 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 RBBP7Q16576 425 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 DCHS2Q6V1P9 2916 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 KIAA1328Q86T90 577 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TTC1Q99614 292 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 GALPQ9UBC7 116 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 SLC39A10Q9ULF5 831 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRH-205ENST00000587662 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 HYKKA2RU49 373 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 OR2A25A4D2G3 310 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 APRTP07741 180 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 PRF1P14222 555 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 NMBRP28336 390 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 MFAP5Q13361 173 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 PRTGQ2VWP7 1150 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 SHISA5Q8N114 240 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 CNDP1Q96KN2 507 aa22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PTPRH-205ENST00000587662 A0A0J9YVX5 310 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms